MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-3

Total Repeats: 906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018611	CAAA	2	8	7	14	75 %	0 %	0 %	25 %	406025808
2	NC_018611	A	7	7	33	39	100 %	0 %	0 %	0 %	406025808
3	NC_018611	T	7	7	54	60	0 %	100 %	0 %	0 %	406025808
4	NC_018611	AT	3	6	126	131	50 %	50 %	0 %	0 %	406025808
5	NC_018611	AAC	2	6	166	171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025808
6	NC_018611	TGA	2	6	177	182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025808
7	NC_018611	GAA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
8	NC_018611	ATTT	2	8	227	234	25 %	75 %	0 %	0 %	406025808
9	NC_018611	A	7	7	264	270	100 %	0 %	0 %	0 %	406025808
10	NC_018611	GAA	2	6	321	326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
11	NC_018611	AGA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
12	NC_018611	ATC	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025808
13	NC_018611	A	8	8	391	398	100 %	0 %	0 %	0 %	406025808
14	NC_018611	TCA	2	6	646	651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025808
15	NC_018611	CTT	2	6	699	704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025808
16	NC_018611	TGA	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025808
17	NC_018611	CAA	2	6	784	789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025808
18	NC_018611	ATC	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025808
19	NC_018611	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
20	NC_018611	TGA	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025808
21	NC_018611	AAG	2	6	933	938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
22	NC_018611	ACT	2	6	968	973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025808
23	NC_018611	TGG	2	6	1006	1011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025808
24	NC_018611	GAA	2	6	1051	1056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025808
25	NC_018611	ATA	2	6	1550	1555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025809
26	NC_018611	GCA	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025809
27	NC_018611	AAG	2	6	1736	1741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025809
28	NC_018611	TGA	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025810
29	NC_018611	T	6	6	1850	1855	0 %	100 %	0 %	0 %	406025810
30	NC_018611	TA	3	6	1944	1949	50 %	50 %	0 %	0 %	406025810
31	NC_018611	TTA	2	6	1980	1985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025810
32	NC_018611	GATA	2	8	2007	2014	50 %	25 %	25 %	0 %	406025810
33	NC_018611	AT	3	6	2022	2027	50 %	50 %	0 %	0 %	406025811
34	NC_018611	TTG	2	6	2030	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025811
35	NC_018611	ACAAA	2	10	2093	2102	80 %	0 %	0 %	20 %	406025811
36	NC_018611	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025811
37	NC_018611	AGA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025811
38	NC_018611	AAC	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025811
39	NC_018611	ACA	2	6	2239	2244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025811
40	NC_018611	CTCAA	2	10	2264	2273	40 %	20 %	0 %	40 %	406025811
41	NC_018611	TTGA	2	8	2275	2282	25 %	50 %	25 %	0 %	406025811
42	NC_018611	TAT	2	6	2315	2320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025811
43	NC_018611	AACG	2	8	2362	2369	50 %	0 %	25 %	25 %	406025811
44	NC_018611	ATA	2	6	2483	2488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025811
45	NC_018611	AG	3	6	2515	2520	50 %	0 %	50 %	0 %	406025811
46	NC_018611	TTA	2	6	2679	2684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025811
47	NC_018611	TTC	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025812
48	NC_018611	TTA	2	6	2775	2780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025812
49	NC_018611	TAA	2	6	2798	2803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025812
50	NC_018611	T	6	6	2899	2904	0 %	100 %	0 %	0 %	406025812
51	NC_018611	TGC	2	6	2919	2924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025812
52	NC_018611	GTT	2	6	3098	3103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406025813
53	NC_018611	T	6	6	3112	3117	0 %	100 %	0 %	0 %	406025813
54	NC_018611	T	6	6	3127	3132	0 %	100 %	0 %	0 %	406025813
55	NC_018611	CTT	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025813
56	NC_018611	AAT	2	6	3209	3214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025813
57	NC_018611	GTG	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025814
58	NC_018611	ATT	2	6	3544	3549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025814
59	NC_018611	TGA	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
60	NC_018611	AAG	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025814
61	NC_018611	GTCA	2	8	3586	3593	25 %	25 %	25 %	25 %	406025814
62	NC_018611	AG	3	6	3598	3603	50 %	0 %	50 %	0 %	406025814
63	NC_018611	TTTTA	2	10	3604	3613	20 %	80 %	0 %	0 %	406025814
64	NC_018611	AGAA	2	8	3670	3677	75 %	0 %	25 %	0 %	406025814
65	NC_018611	AGAA	2	8	3753	3760	75 %	0 %	25 %	0 %	406025814
66	NC_018611	TGA	2	6	3793	3798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
67	NC_018611	AT	3	6	3919	3924	50 %	50 %	0 %	0 %	406025814
68	NC_018611	AAGA	2	8	4007	4014	75 %	0 %	25 %	0 %	406025814
69	NC_018611	A	6	6	4014	4019	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
70	NC_018611	A	7	7	4071	4077	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
71	NC_018611	CGGAT	2	10	4083	4092	20 %	20 %	40 %	20 %	406025814
72	NC_018611	AC	3	6	4128	4133	50 %	0 %	0 %	50 %	406025814
73	NC_018611	GAAA	2	8	4169	4176	75 %	0 %	25 %	0 %	406025814
74	NC_018611	CAA	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
75	NC_018611	AGT	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
76	NC_018611	A	6	6	4298	4303	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
77	NC_018611	GAT	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
78	NC_018611	GCG	2	6	4366	4371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025814
79	NC_018611	TTAA	2	8	4400	4407	50 %	50 %	0 %	0 %	406025814
80	NC_018611	ATT	2	6	4438	4443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025814
81	NC_018611	CAA	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
82	NC_018611	A	7	7	4471	4477	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
83	NC_018611	TAAA	2	8	4491	4498	75 %	25 %	0 %	0 %	406025814
84	NC_018611	A	6	6	4517	4522	100 %	0 %	0 %	0 %	406025814
85	NC_018611	ACG	2	6	4564	4569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
86	NC_018611	AACG	2	8	4625	4632	50 %	0 %	25 %	25 %	406025814
87	NC_018611	TGA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
88	NC_018611	ATT	2	6	4669	4674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025814
89	NC_018611	CAA	2	6	4718	4723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
90	NC_018611	TGA	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
91	NC_018611	ATG	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
92	NC_018611	CTA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025814
93	NC_018611	AGC	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
94	NC_018611	AAG	2	6	4921	4926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025814
95	NC_018611	GCAA	2	8	5047	5054	50 %	0 %	25 %	25 %	406025814
96	NC_018611	CCA	2	6	5057	5062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025814
97	NC_018611	CAA	2	6	5087	5092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
98	NC_018611	TTAT	2	8	5101	5108	25 %	75 %	0 %	0 %	406025814
99	NC_018611	AGCTT	2	10	5115	5124	20 %	40 %	20 %	20 %	406025814
100	NC_018611	ATC	2	6	5139	5144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025814
101	NC_018611	ATG	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
102	NC_018611	T	6	6	5186	5191	0 %	100 %	0 %	0 %	406025814
103	NC_018611	CGA	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
104	NC_018611	CAA	2	6	5261	5266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025814
105	NC_018611	GAC	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
106	NC_018611	CTA	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025814
107	NC_018611	TGA	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025814
108	NC_018611	AGC	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025814
109	NC_018611	TCG	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406025815
110	NC_018611	TAA	2	6	5777	5782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406025815
111	NC_018611	A	6	6	5854	5859	100 %	0 %	0 %	0 %	406025815
112	NC_018611	CGCCAG	2	12	5922	5933	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	406025815
113	NC_018611	GGC	2	6	5943	5948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406025815
114	NC_018611	TGA	2	6	6012	6017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025815
115	NC_018611	ACC	2	6	6091	6096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025815
116	NC_018611	A	6	6	6120	6125	100 %	0 %	0 %	0 %	406025815
117	NC_018611	GAA	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025815
118	NC_018611	CGA	2	6	6167	6172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025815
119	NC_018611	AAC	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025815
120	NC_018611	GTACGA	2	12	6258	6269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406025815
121	NC_018611	ACC	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025815
122	NC_018611	ATT	2	6	6280	6285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025815
123	NC_018611	TGA	2	6	6357	6362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025815
124	NC_018611	AAG	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025815
125	NC_018611	ACC	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406025815
126	NC_018611	CCG	2	6	6506	6511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406025815
127	NC_018611	TGA	3	9	6522	6530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025815
128	NC_018611	ACA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025815
129	NC_018611	GAA	2	6	6757	6762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406025815
130	NC_018611	ATTG	2	8	6810	6817	25 %	50 %	25 %	0 %	406025815
131	NC_018611	CAA	2	6	6859	6864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025815
132	NC_018611	AGCA	2	8	6878	6885	50 %	0 %	25 %	25 %	406025815
133	NC_018611	CGA	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406025815
134	NC_018611	TCT	2	6	6902	6907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406025815
135	NC_018611	TAAA	2	8	6932	6939	75 %	25 %	0 %	0 %	406025815
136	NC_018611	A	6	6	7081	7086	100 %	0 %	0 %	0 %	406025815
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262	NC_018611	A	7	7	15194	15200	100 %	0 %	0 %	0 %	406025822
263	NC_018611	CAA	2	6	15202	15207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406025822
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395	NC_018611	ATT	2	6	23198	23203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025829
396	NC_018611	ATT	2	6	23223	23228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025829
397	NC_018611	GTG	2	6	23247	23252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406025829
398	NC_018611	TTA	2	6	23331	23336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025829
399	NC_018611	TATGGC	2	12	23391	23402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	406025829
400	NC_018611	TGAT	2	8	23465	23472	25 %	50 %	25 %	0 %	406025830
401	NC_018611	ATG	2	6	23543	23548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406025830
402	NC_018611	ATT	2	6	23574	23579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406025830
403	NC_018611	TCA	2	6	23586	23591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406025830
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441	NC_018611	ATGAA	2	10	25367	25376	60 %	20 %	20 %	0 %	406025832
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479	NC_018611	GTCA	2	8	28053	28060	25 %	25 %	25 %	25 %	406025835
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